Ključna razlika - Exome vs Transcriptome
Gen sadrži kodirajuća i nekodirajuća područja unutar sebe. Kodirajuće sekvence su poznate kao egzoni, a nekodirajuće sekvence su poznati kao introni. Nukleotidni slijed eksona gena predstavlja genetski kod gena za sintezu specifičnog proteina. Dakle, egzoni ostaju u molekuli mRNA. Ukupna egzonska regija genoma poznata je kao exome i važan je dio genoma. Genetski kod gena pretvara se u genetski kod molekule mRNA, koji je potreban za proizvodnju proteina. Cijele molekule mRNA transkribirane u stanici ili staničnoj populaciji odjednom poznate su kao transkriptomi. Ključna razlika između exoma i transcriptoma je u tome što exome predstavlja sekvence egzonskih regija genoma, dok transcriptome predstavlja ukupnu mRNA stanice ili tkiva u određenom trenutku.
SADRŽAJ
1. Pregled i ključna razlika
2. Što je Exome
3. Što je Transcriptome
4. Usporedna usporedba - Exome vs Transcriptome
5. Sažetak
Što je Exome?
Geni se sastoje od eksona, introna i regulatornih sekvenci. Egzoni su područja gena koja se tijekom transkripcije transkribiraju u mRNA sekvencu. Introni i druga nekodirajuća područja uklanjaju se tijekom transkripcije. Nukleotidni slijed eksona određuje genetski kod gena koji sintetizira specifični protein koji kodira. Unutar mRNA proteina ostaju samo egzoni. Zbirka eksona u genomu poznata je kao egzom organizma. Predstavlja dio genoma koji se izražava u genima. U ljudi, exome čini 1% od genoma. To je dio ljudskog genoma koji kodira proteine.
Slika 01: Exome
Što je Transcriptome?
Transkriptom je skup svih transkripata koji kodiraju proteine i nekodirajuće transkripte (RNA) u danom tkivu. Transkriptom predstavlja kolekciju ukupnih molekula mRNA eksprimiranih genima u stanici ili tkivu. Transkriptom stanice može se mijenjati s transkriptomom drugog tipa stanice. Transkriptom je također dinamičan - mijenja se s vremenom kao odgovor na unutarnje i vanjske podražaje. Čak i unutar istog tkiva ili unutar istog tipa stanice, transkriptom se može promijeniti nakon nekoliko minuta.
Transkriptom se razlikuje od egzoma organizma. Transkriptom uključuje samo izražene sekvence egome. Iako egzom stanice ostaje isti, transkriptom se razlikuje među stanicama jer ekspresija gena nije jednaka za sve stanice ili tkiva. Samo se bitni geni izražavaju u različitim stanicama i tkivima. Ekspresija gena je proces specifičan za tkivo ili stanicu. Reguliraju ga različiti čimbenici, uključujući čimbenike okoliša. Stoga se transkriptom može razlikovati ovisno o vanjskim uvjetima okoline.
Transkriptom se koristi kao preteča za studije proteomike. Svi proteini potječu iz mRNA sekvenci. Translacijske modifikacije mogu rezultirati promjenama u proteinima. Međutim, transkriptom daje važne osnovne informacije za proteomske studije.
Slika 02: Transkript embrionalnih matičnih stanica
Koja je razlika između Exome i Transcriptome?
Diff Article Sredina prije tablice
Exome vs Transcriptome |
|
| Exome je kolekcija proteinskog kodirajućeg područja gena. | Transkriptom je skup svih transkribiranih RNA, uključujući mRNA. |
| Uzorak | |
| Exome se proučava pomoću DNA uzorka. | Transkriptom se proučava pomoću uzorka RNA. |
| Metoda proučavanja | |
| Sekvenciranje cijelog exomea metoda je proučavanja exomea. | RNA sekvenciranje metoda je proučavanja transkriptoma. |
Sažetak - Exome vs Transcriptome
Egzoni su kodirajuće sekvence gena i određuju mRNA sekvence proteina. Zbirka ovih kodirajućih sekvenci (egzoni) poznata je kao egzom organizma. Geni se transkribiraju u molekule mRNA prije stvaranja proteina. Ukupne molekule mRNA stanice ili tkiva u bilo kojem trenutku poznate su kao transkriptomi. Transkriptom predstavlja gene koji se aktivno eksprimiraju u mRNA u bilo kojem trenutku. Transkriptom je specifičan za stanice i tkiva i utječe na uvjete okoline. To je razlika između exome i transcriptome.
