Ključna razlika između neravnoteže genetske povezanosti i neravnoteže veza je u tome što je genetska povezanost tendencija da dva ili više gena istog kromosoma ostanu zajedno u procesu nasljeđivanja, dok je neravnoteža veze ne slučajna povezanost alela na različitim lokusima u populaciji..
Genetska povezanost i neravnoteža povezanosti dva su pojma u genetici koja slijede nemendelovsko nasljeđivanje. Genetska povezanost odnosi se na fizičko stanje povezanosti u kromosomu. Jednostavnim riječima, to je postupak u kojem su geni usko smješteni u kromosomu tako da se uvijek zajedno nasljeđuju u spolne stanice. S druge strane, u populacijskoj genetici, neravnoteža povezanosti odnosi se na ne slučajnu povezanost alela na različitim lokusima u populaciji. To je mjera razlike između promatrane učestalosti određene kombinacije alela na dva lokusa i učestalosti koja se očekuje za slučajnu povezanost.
