Ključna razlika između transgenih i nokaut miševa je u tome što transgeni miševi imaju strane gene koji su umetnuti u njegov genom, dok miševi s nokautima imaju funkcionalno inaktivirani gen od interesa.
Genetski inženjering je područje genetike u kojem se genetski sastav organizma modificira ili manipulira tehnologijom rekombinantne DNA. Transgeni organizmi nastaju unošenjem stranih gena (transgena) u organizme pomoću biotehnologije. Nazivaju ih i genetski modificiranim organizmima. Transgeni organizmi dragocjeni su istraživački alat. Važni su u istraživanju funkcije gena te u genskoj terapiji i poljoprivredi. Miševi se koriste kao laboratorijski životinjski modeli jer su usko povezani s ljudima. Transgeni miševi i nokautirani miševi dvije su vrste genetski modificiranih životinja. U transgenih miševa DNK domaćina u lokusu zamjenjuje se drugom verzijom istog gena ili potpuno drugim genom. U nokautiranih miševa gen domaćina jednostavno se briše ili funkcionalno inaktivira.
