Ključna razlika između metode agarne bušotine i metode difuzije diska je ta što se kod metode difuzije agarne bušotine otopina ekstrakta puni u rupu ili jažicu stvorenu na agarskom mediju, dok se kod metode difuzije agar diska disk filtrirajućeg papira koji sadrži test otopinu postavljeni na površinu agara.
Mikroorganizmi su uzročnici mnogih bolesti. Postoje različita antimikrobna sredstva koja ubijaju mikroorganizme i inhibiraju ili zaustavljaju njihov rast. Za otkrivanje antimikrobne aktivnosti dostupne su razne metode pregleda i procjene. Među njima su metode difuzije agarnih bušotina i metode difuzije agar diska uobičajene metode u in vitro analizi, koje su agar difuzione metode. Ove se metode široko koriste jer ne zahtijevaju određenu opremu i daljnju procjenu ponovljivosti i standardizacije. Obje metode ovise o difuziji antimikrobnog sredstva kroz agar medij.
