Ključna razlika između pomračenja i latentnog razdoblja je u tome što je razdoblje pomrčine vrijeme sinteze fagovih proteina i nukleinskih kiselina unutar stanice domaćina, dok je latentno razdoblje vrijeme između ubrizgavanja virusnog genoma u stanicu i lize stanica domaćina.
Bakteriofag (fag) je obvezna unutarstanična virusna čestica koja inficira i širi se unutar određene bakterije. Oni su također poznati kao izjedači bakterija jer djeluju kao baktericidna sredstva. Složeni oblik glave i repa najčešći je oblik koji pokazuju bakteriofagi. Inficiraju bakterije domaćina kako bi se razmnožile. Na početku infekcije čvrsto se vežu za staničnu stijenku bakterija koristeći svoje površinske receptore i ubrizgavaju svoj genetski materijal u stanicu domaćina. Tada se njihova infekcija može dogoditi kroz dva ciklusa: litički i lizogeni ciklus.
U litičkom ciklusu bakteriofagi inficiraju bakterije i lizijom brzo ubijaju bakterijsku stanicu domaćina. U lizogenom ciklusu, virusni genetski materijal integrira se s bakterijskim genomom ili plazmidima i postoji unutar stanice domaćina tijekom mnogih generacija bez ubijanja bakterije domaćina. Proces zaraze slijedi različita razdoblja poput latentnog razdoblja, razdoblja pomrčine, razdoblja uspona itd.
