Ključna razlika - Gel elektroforeza naspram SDS stranice
Gel elektroforeza je tehnika koja razdvaja makromolekule u električnom polju. Uobičajena je metoda u molekularnoj biologiji odvajanje DNA, RNA i proteina od smjesa prema njihovoj molekularnoj veličini. SDS Page je vrsta gel elektroforeze koja se koristi za odvajanje proteina od proteinske smjese na temelju njihove veličine. Gel elektroforeza je izraz koji se koristi za označavanje normalne tehnike koja se primjenjuje za odvajanje DNA, RNA i proteina, dok je SDS Page jedna vrsta gelske elektroforeze. To je ključna razlika između gel elektroforeze i SDS stranice.
SADRŽAJ
1. Pregled i ključna razlika
2. Što je gelska elektroforeza
3. Što je SDS stranica
4. Usporedna usporedba - Gel elektroforeza naspram SDS Stranica
5. Sažetak
Što je elektroforeza u gelu?
Gel elektroforeza uobičajena je tehnika koja se koristi u laboratorijima za odvajanje nabijenih molekula poput DNA, RNA, proteina itd. Od njihovih smjesa. Gel se koristi u gel elektroforezi. Djeluje kao molekularno sito. Postoje dvije vrste gelova koji se koriste u elektroforezi u gelu, a to su agaroza i poliakrilamid. Odabir gela i pripravka gela važni su čimbenici koje treba uzeti u obzir kod gel elektroforeza, jer veličinom pora gela treba pažljivo manipulirati radi dobrog odvajanja molekula kroz gel elektroforezu. Elektroforeza u gelu ima električno polje povezano s dva kraja gela. Jedan kraj gela pokazuje pozitivan naboj, dok je drugi kraj negativno nabijen.
DNA i RNA su negativno nabijene molekule. Jednom kad se natovare u gel s negativnog kraja gela i nanesu na električno polje, migriraju kroz pore gela prema pozitivno nabijenom kraju gela. Brzina migracije ovisi o naboju i veličini molekule. Manje molekule lako migriraju kroz pore gela od većih molekula. Dakle, manje molekule putuju kroz gel na veliku udaljenost, a veće na malu. Za promatranje putovanja molekula po gelu koriste se posebne vrste boja. Električno polje primjenjuje se tijekom određenog vremenskog razdoblja i zaustavlja kako bi se spriječio gubitak molekula i kako bi se molekule zadržale na putovanjima. U gelu se mogu uočiti različite trake. Te trake predstavljaju molekule različitih veličina. Stoga,gel elektroforeza korisna je za razlikovanje molekula prema njihovoj veličini.
Gel elektroforeza ugrađena je u razne tehnike kao preparativna tehnika u molekularnoj biologiji poput PCR-a, RFLP-a, kloniranja, sekvenciranja DNK, blottinga sa strane, mapiranja genoma itd.
Slika 01: Elektroforeza u agaroznom gelu
Što je SDS stranica?
Elektroforeza u natrijevom dodecil sulfatu u poliakrilamidnom gelu (SDS Stranica) vrsta je elektroforeze u gelu koja se koristi za odvajanje proteina. Kada se za odvajanje proteina koristi gel elektroforeza, potrebni su posebni tretmani jer proteini nisu negativno nabijeni poput DNA i RNA i ne migriraju prema pozitivnom ili negativnom kraju. Stoga su proteini denaturirani i prevučeni negativnim nabojem prije gel elektroforeze. Radi se pomoću deterdženta koji se naziva natrijev dodecil sulfat (SDS). Gel elektroforeza koja koristi SDS i poliakrilamidni gel za noseći medij poznata je pod nazivom SDS Page. Ova se tehnika obično koristi u biokemiji, genetici, forenzici i molekularnoj biologiji.
Tijekom SDS stranice proteini se miješaju sa SDS-om. SDS razvija proteine u linearni oblik i oblaže ih negativnim nabojem proporcionalnim njihovoj molekularnoj masi. Zbog negativnog naboja, molekule proteina migriraju prema kraju pozitivnog naboja gela i odvajaju se prema svojim molekularnim masama. U SDS stranici, poliakrilamid se koristi kao čvrsti nosač gela. Stvarno razdvajanje proteina uglavnom ovisi o svojstvima gela. Stoga treba pažljivo raditi pripremu poliakrilamidnog gela i koristiti ispravne koncentracije poliakrilamida. Poliakrilamidni gelovi pokazuju visoku rezoluciju od agaroznih gelova. Stoga se SDS Stranica smatra tehnikom visoke razlučivosti za odvajanje proteina.
SDS Stranica je vrsta denaturacijske gel elektroforeze. Ima veliko ograničenje u analizi proteina. Budući da SDS denaturira proteine prije razdvajanja, ne dopušta otkrivanje enzimske aktivnosti, interakcije vezanja na proteine, proteinske kofaktore itd.
Slika 02: SDS stranica
Koja je razlika između elektroforeze u gelu i SDS stranice?
Elektroforeza u gelu vs SDS stranica |
|
| Gel elektroforeza je metoda koja se izvodi za odvajanje makromolekula pomoću električnog polja. | SDS Page je tehnika elektroforeze u gelu visoke rezolucije koja se koristi za odvajanje proteina na temelju njihove mase. |
| Gel Run | |
| Može se izvoditi vodoravno ili okomito. | Stranica SDS-a uvijek radi okomito. |
| Osnova za razdvajanje | |
| Razdvajanje se događa prema naboju i veličini. | Odvajanje proteina događa se prema masi i naboju. |
| Razlučivost | |
| Elektroforeza u agaroznom gelu ima nisku razlučivost, a elektroforeza u poliakrilamidnom gelu ima višu razlučivost | SDS Stranica ima bolju razlučivost. |
| Denaturacija | |
| Gel elektroforeza uključuje i denaturacijske i nedenaturirajuće tehnike. | SDS Page denaturira proteine prije razdvajanja. |
Sažetak - Elektroforeza u gelu nasuprot SDS stranici
Elektroforeza u gelu uobičajena je tehnika koja se koristi za odvajanje i analizu DNA, RNA i proteina na temelju njihove veličine i naboja. Dvije su glavne vrste elektroforeze u gelu, a to su elektroforeza u agaroznom gelu i elektroforeza u poliakrilamidnom gelu. Agarozni gelovi koriste se uglavnom za odvajanje nukleinske kiseline; kada je potrebna veća rezolucija, koriste se poliakrilamidni gelovi. SDS Page je vrsta elektroforeze u gelu koja se obično koristi za odvajanje složenih smjesa proteina. Smatra se tehnikom odvajanja proteina visoke rezolucije. To je razlika između gel elektroforeze i SDS stranice.
