Ključna razlika između Pseudomonas aeruginosa i Pseudomonas fluorescens je u tome što je P. aeruginosa oportunistički ljudski patogen, dok P. fluorescens nije ljudski patogen. Preciznije rečeno, P. aeruginosa je patogen biljaka i životinja, uključujući čovjeka, dok je P. fluorescencija biljni rast koji potiče bakterijske vrste. Druga važna razlika između Pseudomonas aeruginosa i Pseudomonas fluorescens je ta što P. aeruginosa ima sposobnost rasta čak i na 42 ° C.
Pseudomonas je rod bakterija koji sadrži gram negativne, štapičaste i polarne bičevane bakterije. Oni su aerobne bakterije koje ne tvore spore, pozitivne su na katalazu i pozitivne su na oksidazu. Nadalje, ovaj rod ima mnogo vrsta, uključujući P. aeruginosa, P. fluorescens, P. putida, P. syringae itd.