Ključna razlika između E. coli i Klebsielle je u tome što je E. coli gram-negativna bakterija u obliku štapića koja je pokretna, dok je Klebsiella rod gram-negativnih bakterija u obliku štapića koja nije pokretna.
Escherichia i Klebsiella dva su uobičajena roda koliformnih bakterija. Oba roda sastoje se od gram-negativnih bakterija u obliku štapića i oblika spore. E. coli je vrsta Escherichije. To je pokretna fekalna koliformna bakterija. I bakterije E. coli i Klebsiella pripadaju porodici Enterobacteriaceae. Oni su dio normalne flore u našim crijevima. Nadalje, oni su fakultativni anaerobi. Obje su općenito bezopasne, ali u određenim situacijama postaju oportunistički ljudski patogeni.