Ključna razlika između kariotipa i idiograma je u tome što je kariotip stvarna slika ukupnih kromosoma stanice, dok je idiogram shematski dijagram kariotipa koji ilustrira sve karte kromosoma.
Skup kromosoma predstavlja genom i genetske informacije organizma. Svaki kromosom ima jedinstveni oblik, veličinu i skup gena. Broj i fizička struktura kromosoma otkrivaju važne informacije o organizmu. Kariotipizacija je tehnika koja se izvodi za ispitivanje kompletnog skupa kromosoma u stanici. Tijekom ovog ispitivanja prikupljaju se i analiziraju ukupni kromosomi kako bi se utvrdilo postoje li numeričke ili strukturne abnormalnosti u kromosomima. Stvarna slika koja prikazuje ukupne kromosome stanice je kariotip, dok je shematski dijagram ukupnih kromosoma stanice idiogram. Oboje je važno u citogenetskim studijama.
