Ključna razlika između ubikinona i citokroma je ta što ubikinoni (CoQ) nisu proteini, dok su citokromi proteini.
Lanac prijenosa elektrona završna je faza aerobnog disanja. Stoga se javlja u unutarnjoj membrani mitohondrija. Štoviše, sastoji se od elektronskih nosača koji olakšavaju stvaranje protonskog gradijenta preko membrane. Osim NAD i flavoproteina, ubikinoni i citokromi su dvije vrste nosača elektrona koji sudjeluju u lancu transporta elektrona. Ubikinoni su hidrofobne organske molekule netopive u lipidima, dok su citokromi proteini koji sadrže željezo.
