Ključna razlika između citokroma i fitokroma je ta što je citokrom hem protein koji prenosi elektrone i koji sudjeluje u aerobnom disanju. U međuvremenu, fitokrom je protein fotoreceptora koji je osjetljiv na crvenu i krajnje crvenu svjetlost vidljivog spektra.
Živi organizmi imaju različite vrste pigmenata. Neki su pigmenti koji upijaju svjetlost, dok su neki respiratorni. Citohrom je metaloprotein koji djeluje kao nosač elektrona u aerobnom disanju. U međuvremenu, fitokrom je fotoreceptor koji apsorbira crvenu i krajnje crvenu svjetlost iz vidljivog spektra. U usporedbi s citokromom, fitokromi su važni u mnogim aspektima razvoja biljaka.