Ključna razlika između radioaktivnih i neradioaktivnih sondi je u tome što su radioaktivne sonde jednolančane sekvence DNA ili RNA koje su obilježene radioaktivnim izotopima, dok su neradioaktivne sonde jednolančane DNA ili RNA sekvence koje su obilježene kemijskom oznakom ili fluorescentnom oznakom.
Hibridizacija nukleinske kiseline važna je tehnika u molekularnoj biologiji, posebno u mikrobnoj dijagnozi. Pomaže u identificiranju ili otkrivanju određenog slijeda nukleinske kiseline. U ovoj se tehnici nukleinske kiseline fiksiraju na čvrstu površinu i hibridiziraju sondom. Sonda je fragment DNA ili RNA koji je komplementaran nizu od interesa. Ako je ciljana sekvenca prisutna u uzorku, sonda će se hibridizirati s njom i učiniti je detektibilnom. Postoje dvije vrste sondi kao radioaktivne i neradioaktivne sonde. Stoga sonde možemo označiti radioaktivnom ili fluorescentnom pločicom.
