Ključna razlika - genotipizacija vs sekvenciranje
Genotipizacija i sekvenciranje dvije su tehnike izvedene za dobivanje informacija o nukleinskim kiselinama, uglavnom o DNK organizma. Ključna razlika između genotipiziranja i sekvenciranja je u tome što je genotipizacija postupak određivanja genetske varijante koju pojedinac posjeduje pomoću markera, dok je sekvenciranje određivanje ispravnog redoslijeda nukleotidne sekvence unutar datog fragmenta DNA.
SADRŽAJ
1. Pregled i ključna razlika
2. Što je genotipizacija
3. Što je sekvenciranje
4. Usporedna usporedba - Genotipizacija vs sekvenciranje
5. Sažetak
Što je genotipizacija?
Genotipizacija je određivanje genetskog sastava pojedinca pomoću niza DNA i markera te usporedba i identifikacija njegovog nasljeđivanja. Genotipizacija je važna u evolucijskoj biologiji, populacijskoj biologiji, taksonomiji, ekologiji i genetici organizama. Može se izvesti različitim tehnikama, uključujući sekvenciranje DNA, lančanu reakciju polimeraze, polimorfizam duljine restrikcijskog fragmenta (RFLP), slučajno pojačanu polimorfnu detekciju, polimorfizam pojačane duljine fragmenata (AFLP), mikroniže DNA, itd.
Genotipizacija uključuje sekvenciranje određenih malih fragmenata DNA sekvenci i utvrđivanje povezanosti genetskog sastava s drugim jedinkama pomoću genetskih markera. Utvrđuje pojedinačne nukleotidne polimorfizme (SNP) među pojedincima ili specifične alele. Genotipizacija je primjenjiva na širok raspon organizama, uključujući ljude. Također je primjenjiv na mikroorganizme poput virusa, gljivica itd. I može se koristiti za određivanje njihovih genetskih varijanti s referentnim profilima. U molekularnoj epidemiologiji i forenzičkoj mikrobiologiji suzbijanje patogena, posebno mikroorganizama, vrši se informacijama dobivenim genotipizacijom. Genotipizacija je vrlo važna u analizi rodovnice. Ljudi su genotipizirani kako bi potvrdili majčinstvo i očinstvo. Genotip će otkriti dominantne i recesivne alele gena koji odlučuju o određenim osobinama.
Slika_1: RFLP genotipizacija
Što je sekvenciranje?
Sekvenciranje je postupak određivanja ispravnog redoslijeda nukleotida u danom fragmentu DNA ili RNA. Gotovo sve informacije potrebne za rast i razvoj organizma kodirane su u njegovom genomu. Dostupnost tehnika za proizvodnju i odvajanje nekoliko stotina fragmenata nukleinskih kiselina dugih nukleotida dovela je do razvoja postupaka određivanja točnog nukleotidnog slijeda datog fragmenta DNA ili RNA. Danas su dostupne različite vrste sekvenciranja. Ove metode sekvenciranja, zajedno s tehnologijama za izgradnju biblioteka genoma koje predstavljaju čitav genom organizma, olakšavaju sekvenciranje cijelog genoma tog organizma, čineći dubinsku analizu genskih struktura, funkcija gena, lokacija gena, ekspresije gena, mapiranje gena, regije za regulaciju gena itd.
Sekvencirani su i mapirani ukupni genomi mnogih virusa, nekoliko bakterija, arhebakterija, kvasca i nekoliko drugih organizama. Projekt ljudskog genoma omogućio je sekvenciranje i mapiranje cijelog ljudskog genoma i objavio svoj prvi nacrt 2003. godine. To je glavna prekretnica u napretku biologije. Sekvence humanog genoma sada se koriste u medicinskom sektoru za utvrđivanje genetskih uzroka rijetkih bolesti, utvrđivanje rizika od bolesti novorođenčadi, utvrđivanje genetskih detalja različitih karcinoma, razvoj novih terapeutskih sredstava i razvoj novih dijagnostičkih alata itd.
U biljnom svijetu sekvencirani su genom riže i Arabidopsis. Znanje o tim redoslijedima nesumnjivo će revolucionirati naše razumijevanje kako stanice i organizmi funkcioniraju.
Slika_2: Autoradiograf sekvenciranja sangera
Koja je razlika između genotipiziranja i sekvenciranja?
Diff Article Sredina prije tablice
Genotipizacija vs sekvenciranje |
|
| Genotipizacija je postupak utvrđivanja genetskog sastava jedinke i provjere grupe ili taksonomije tog organizma. | Sekvenciranje je postupak određivanja preciznog redoslijeda nukleotida određenog DNA ili RNA fragmenta. |
| Tehnike | |
| RFLP, sekvenciranje gena, PCR, DNA mikromreže, AFLP itd. | Sanger sekvenciranje, Gilbertovo sekvenciranje, pirosekvenciranje, sekvenciranje sljedeće generacije, sekvenciranje sačmarice itd. |
| Glavne brige | |
| Ovo je više zabrinuto zbog toga daju li razlike u genotipu stvarne razlike u fenotipu. | To je više zabrinuto za poredak nukleotida i njegove razlike i promjene s drugim organizmima. |
Sažetak - Genotipizacija vs sekvenciranje
Genotipizacija i sekvenciranje korisni su za proučavanje genetskih informacija organizama. Genotipizacija je postupak utvrđivanja varijacija genotipa među pojedincima i pronalaženja njihovih kategorija. Sekvenciranje je postupak određivanja ispravnog redoslijeda nukleotida u zainteresiranom fragmentu ili regiji DNA. Obje tehnike daju važne informacije o genima i genomima.
