Ključna razlika između komplementarnih i suplementarnih gena je u tome što komplementarni geni zahtijevaju prisutnost svakog gena u izražavanju osobine, dok samo jedan gen od dva suplementarna gena zahtijeva prisutnost drugog gena kada izražava svojstvo.
Geni međusobno komuniciraju kada proizvode osobinu kod pojedinca. Te su interakcije složene i potrebna im je dubinska analiza kako bi se razumjelo kako rade zajedno i kako prisutnost gena utječe na izražavanje osobina. Komplementarni i suplementarni geni dvije su takve vrste gena koje međusobno djeluju prilikom stvaranja neke osobine. Oni pokazuju epistatičke interakcije gena što znači da učinak jednog gena ovisi o prisutnosti drugog gena.
