Ključna razlika između ekspresije gena i regulacije gena je u tome što je ekspresija gena proces koji stvara funkcionalni protein ili RNA iz genetskih informacija skrivenih u genu, dok je regulacija gena proces koji inducira ili potiskuje ekspresiju gena.
Gen je specifični fragment DNA smješten u kromosomu. Sastoji se od introna koji su nekodirajuće sekvence i eksona koji su kodirajuće sekvence. Geni se podvrgavaju ekspresiji kroz dva glavna koraka kako bi proizveli proteine. Specifični redoslijed nukleotida određuje rezultirajući protein. Stoga je jako važno ekspresirati i regulirati gene kako bi se spriječilo stvaranje nepotrebnih proteina koji mogu uzrokovati razne probleme, uključujući genetske poremećaje, sindrome itd. Stoga su ekspresija gena i regulacija gena dva izuzetno važna procesa koja se javljaju u živim organizmima. Međutim, niti jedan od ovih procesa ne odvija se odvojeno; oba se procesa odvijaju istovremeno.