Ključna razlika između glukogenih i ketogenih aminokiselina je u tome što glukogene aminokiseline proizvode piruvat ili bilo koje druge preteče glukoze tijekom njihovog katabolizma, dok ketogene aminokiseline proizvode acetil CoA i acetoacetil CoA tijekom njihovog katabolizma.
Aminokiseline su temeljne molekule koje čine kemijsku strukturu proteina i polipeptida. Iako postoje različite klasifikacije aminokiselina, možemo ih klasificirati kao glukogene i ketogene aminokiseline, ovisno o međuproduktima koji nastaju tijekom njihovog katabolizma. Kao što je gore spomenuto, krajnji produkt katabolizma aminokiselina daje dvije vrste međuprodukata; bilo piruvat (ili drugim prekursorima glukoze) ili acetil CoA i acetoacetil CoA.
