Ključna razlika između alfa i beta zavojnice temelji se na vrsti vodikovih veza koje nastaju u razvoju ovih struktura. Alfa zavojnice tvore unutarmolekularne vodikove veze, dok beta zavojnice tvore međumolekularne vodikove veze.
Složeni proteini imaju četiri strukturno organizacijske razine - primarnu, sekundarnu, tercijarnu i kvaternarnu. Sekundarne strukture proteina tvore peptidne lance u različitim orijentacijama. Peptidni lanci sastoje se od aminokiselinskih sekvenci vezanih peptidnim vezama. Stoga postoje dvije glavne sekundarne strukture u proteinima kao što su alfa spirala i beta spirala. Pored toga, postoje i druge sekundarne strukture koje se nazivaju beta okret i ukosnice. Ovaj se članak uglavnom fokusira na razliku između alfa i beta zavojnice.
