Ključna razlika između alfa i beta anomera je ta što je u alfa anomeru hidroksilna skupina na anomernom ugljiku cis do egzocikličkog kisika u anomernom središtu, dok je kod beta anomera hidroksilna skupina trans do egzocikličkog kisika.
Anomer je geometrijska varijacija među ugljikohidratima. To je vrsta epimera u kojem možemo vidjeti anomerni atom ugljika. Anomerni atom ugljika izveden je iz karbonilnog ugljika otvorene lančane strukture ugljikohidrata. Stoga se stvaranje cikličke strukture iz otvorene lančane strukture naziva anomerizacija.