Ključna razlika između alfa i beta tubulina je u tome što alfa tubulin sadrži Asp-254 na E-mjestu, dok beta-tubulin sadrži Lys-254 na N-mjestu. Osim toga, GTP je uvijek vezan za podjedinicu alfa-tubulina, dok je za beta-tubulinsku podjedinicu GTP zamjenjiv za polimerizaciju mikrofilamenata.
Mikrotubule su dio citoskeleta citoplazme eukariotskih stanica. Stoga mikrotubuli postoje kao mreža proteinskih niti raspoređenih po stanici pružajući određeni oblik stanici i zadržavajući organele na mjestu. Štoviše, sastoje se od dva glavna tubulinska proteina, naime alfa i beta tubulina. Alfa i beta dvije su obitelji eukariotske nadporodice tubulina. Alfa i beta tubulin postoji kao dimer i on je osnovni gradivni element mikrotubula.