Ključna razlika između RP HPLC i HIC je u tome što RP HPLC koristi polarniju mobilnu fazu i manje polarnu stacionarnu fazu. Dok HIC koristi hidrofobnu stacionarnu fazu koja omogućava hidrofobnim molekulama da se prikače na nju.
Kromatografija je analitička tehnika koja pomaže razdvajanju smjese na njezine komponente. Prvo, moramo otopiti uzorak da se odvoji u otopinu. Ova smjesa otopine i tvari naziva se pokretna faza. Tada se pokretna faza propušta kroz drugi materijal koji se naziva stacionarna faza. Stacionarna faza određuje odvajanje komponenata. Do razdvajanja dolazi zbog razdvajanja materijala između mobilne i stacionarne faze.