Ključna razlika između HPLC reverzne faze i normalne faze je ta što HPLC reverzne faze koristi nepolarnu stacionarnu fazu i polarnu pokretnu fazu, dok HPLC normalne faze koristi polarnu stacionarnu fazu i manje polarnu mobilnu fazu.
HPLC u normalnoj fazi najstarija je tehnika HPLC koju je Tswett koristio u odvajanju biljnih ekstrakata; koristio je kredu u staklenom stupcu. Ovo je bio klasični način kromatografije koji je doveo do imenovanja kao "normalne" tehnike. HPLC obrnute faze, s druge strane, suprotnost je normalnoj tehnici, koju su znanstvenici nedavno razvili.