Ključna razlika između CRISPR-a i restrikcijskih enzima je u tome što je CRISPR prirodni prokariotski imunološki obrambeni mehanizam koji se nedavno koristi za uređivanje i modificiranje eukariotskih gena, dok su restrikcijski enzimi biološke škare koje molekule DNA cijepaju na manje tvari.
Uređivanje genoma i modifikacija gena zanimljiva su i inovativna područja u genetici i molekularnoj biologiji. Studije genske terapije široko koriste modifikaciju gena. Štoviše, modifikacija gena korisna je u identificiranju svojstava gena, funkcionalnosti gena i kako bi mutacije gena mogle utjecati na njegovu funkciju. Važno je izvesti učinkovite i pouzdane načine za precizne, ciljane promjene u genomu živih stanica. CRISPR i restriktivni enzimi igraju ključnu ulogu u modifikacijama gena. CRISPR modificira gene s velikom preciznošću. Restrikcijski enzimi djeluju kao biološke škare koje molekule DNA cijepaju na manje tvari.
