Ključna razlika između kodominance i više alela je u tome što kodominanca izražava učinke oba alela neovisno, bez miješanja u heterozigotnom stanju, dok se više alela odnosi na stanje svojstva koje ima više od dva različita alela.
Općenito, svaki gen dolazi s dva različita alela. Jedan je dominantni alel, dok je drugi recesivni alel. Prema mendelovskom nasljeđivanju, dominantni alel izražava svoj fenotip istodobno suzbijajući recesivni alel u heterozigotnom stanju. Međutim, neki geni imaju tri ili više različitih alela za jedno svojstvo. Zovu se višestruki aleli. Štoviše, kodominancija je nemendelsko nasljeđe. U ovom fenomenu, potomstvo prima oba roditeljska gena kao kombinaciju oba gena. Stoga su oba gena podjednako izražena u potomstva.