Ključna razlika između holandričkog i spolno vezanog gena je u tome što je holandrički gen oblik gena vezanog za spol koji se nalazi na Y kromosomu, dok je spolno povezani gen gen smješten na spolnim kromosomima.
Par spolnih kromosoma može odlučiti o spolu ljudi i drugih sisavaca. Mužjaci imaju XY kromosome, dok ženke imaju XX kromosome. X i Y kromosomi nisu homologni. Oni također ne nose iste gene. Y kromosom je kraći i nosi mali broj gena u usporedbi s X kromosomom. Geni na X kromosomu poznati su kao X povezani geni. Slično tome, geni smješteni na Y kromosomu poznati su kao Y povezani geni ili holandrički geni. I X povezani i Y povezani geni poznati su kao geni povezani sa spolom.