Ključna razlika - Probe vs Primer
Molekularna sonda je mali fragment DNA ili RNA koji prepoznaje komplementarne sekvence u DNA ili RNA i omogućuje identifikaciju ciljne sekvence. Primer je mali dio DNA ili RNA koji služi kao polazna točka za sintezu DNA. Primeri i sonde hibridiziraju se s komplementarnim nukleotidima DNA predloška ili ciljane DNA. Međutim, ključna razlika između sonde i primera je u tome što su početnici neophodni za replikaciju DNA, dok su sonde neophodni za otkrivanje specifičnih sekvenci u uzorku DNA.
SADRŽAJ
1. Pregled i ključna razlika
2. Što je sonda
3. Što je primer
4. Usporedba usporedno - Sonda vs Primer
5. Sažetak
Što je sonda?
Sonda je mali fragment DNA ili RNA koji se koristi za otkrivanje ciljne DNA ili RNA u uzorku molekularnom hibridizacijom. Poznati su i kao molekularni biljezi. Duljina sonde može varirati (100 do 1000 baza), a nukleotidi sonde komplementarni su dijelu ciljane sekvence. Radi lakšeg otkrivanja, sonde su označene radioaktivnim izotopima ili fluorescentnim bojama ili antitijelima. Sonde se vežu s komplementarnim bazama ciljane sekvence i otkrivaju prisutnost ciljne DNA ili RNA u uzorku. Dvije su glavne metode označavanja sondi: krajnje označavanje i prijevod nadimaka. Sonde se svrstavaju u različite tipove, uključujući DNA sonde, RNA sonde, cDNa sonde i sintetičke oligonukleotidne sonde, a pripremaju se različitim tehnikama.
Sonde su važan alat u mnogim mikrobnim i molekularnim područjima kao što su virologija, forenzička patologija, ispitivanje očinstva, DNK otisci prstiju, otkrivanje genetskih bolesti, RFLP, molekularna citogenetika, hibridizacija in situ, itd.
Slika 01: Fluorescentno obilježena sonda koja se koristi u FISH-u za otkrivanje patogena
Što je Primer?
Primer je kratki DNA ili RNA fragment koji služi kao inicijator za sintezu DNA. Enzim DNA polimeraza dodaje nukleotide u 3 'OH skupinu početnih sekvenci i sintetizira novi lanac komplementaran s matričnom DNA. Primeri su vrlo kratki fragmenti duljine od 18 do 20 nukleotida. Kemijski se sintetiziraju u laboratoriju za in vitro pojačavanje DNA (PCR). Primeri mogu imati bilo koji slijed nukleotida budući da ih je dizajnirao korisnik. Oni se sintetiziraju kako bi se podudarali s komplementarnim bazama DNA matrice. Stoga može imati bilo koji slijed nukleotida. Primeri su od najveće važnosti za replikaciju DNA, jer DNA polimeraza ne može sintetizirati novu DNA bez prethodno postojećeg dijela DNA. Prilikom dizajniranja početnica za PCR, treba uzeti u obzir sljedeće:
- Primeri bi trebali sadržavati komplementarne nukleotide na bočnom kraju DNA koji se želi pojačati.
- Temeljni premazi trebali bi imati temperaturu topljenja između 55 - 65 0 C
- Sadržaj G i C trebao bi biti između 50 do 60%.
Dvije se početnice koriste u PCR-u kao naprijed i natrag kako bi se replicirale obje niti DNA uzorka. Primeri se obično koriste za provođenje PCR-a i DNA sekvenciranja.
Slika 02: Kaljenje primera u PCR-u
Koja je razlika između sonde i primera?
Diff Article Sredina prije tablice
Sonda vs Primer |
|
| Sonda je mali fragment DNA / RNA koji se koristi za otkrivanje prisutnosti ciljne sekvence u uzorku molekularnom hibridizacijom. | Primer je mali dio DNA ili RNA koji služi kao polazna točka za replikaciju DNA. |
| Funkcija | |
| Ovo otkriva prisutnost određene sekvence u uzorku DNA ili RNA. | To djeluje kao polazna točka za sintezu DNA. |
| Duljina | |
| Duljina može biti u rasponu od 100 - 1000 baza | Duljina je uglavnom oko 18 - 20 baza |
| Vezanje komplementarnom sekvencom | |
| Sonda hibridizira s komplementarnim bazama ciljane sekvence | Primarni žarovi s komplementarnim bazama DNA lanaca. |
| Označavanje | |
| Sonde su označene radi lakšeg otkrivanja | Primeri uglavnom nisu označeni |
| Upotreba u PCR-u | |
| Sonde se ne koriste u PCR-u | Primeri se koriste u PCR-u |
Sažetak - Sonda vs Primer
Sonda je mali fragment DNA ili RNA sekvence koji se može hibridizirati s komplementarnim nukleotidima kako bi se otkrila ciljna sekvenca u uzorku. Sonde su označene radioaktivno, imunološki ili fluorescentno kako bi se vidjela prisutnost ciljne sekvence. Primer je vrlo mali fragment DNA ili RNA koji djeluje kao polazna točka za in vitro pojačavanje DNA. DNA polimeraza identificira početnik 3 'OH skupine i započinje izgradnju novog lanca komplementarnog predlošku. Sonde i početnice djeluju slično hibridiziranjem s komplementarnim nukleotidima. Stoga je ključna razlika između sonde i primera njihova glavna funkcija.
