Ključna razlika između VNTR i sonde je ta što je VNTR kratka nukleotidna sekvenca koja se javlja kao tandem ponavljanje u genomu, dok je sonda umjetno sintetizirana kratka sekvenca DNA ili RNA koja se može radioaktivno obilježiti.
VNTR označava tandem ponavljanje promjenjivog broja. To je kratka nukleotidna sekvenca organizirana u tandemskim ponavljanjima u genomu. VNTR se prirodno javljaju u našem genomu. Sonda je umjetno sintetizirana kratka sekvenca DNA ili RNA. I sonda i VNTR su nukleinske kiseline ili kratke nukleotidne sekvence. Neizmjerno se koriste u različitim molekularno-biološkim tehnikama, uglavnom u forenzičkim studijama. VNTR i sonda dijele neke sličnosti kao i razlike. Stoga članak pokušava istaknuti razliku između VNTR i sonde.
