Ključna razlika između Iso i Sec u organskoj kemiji je ta što terminom iso nazivamo organski spoj koji sadrži sve atome ugljika, osim jednog koji čini kontinuirani lanac, dok izrazom sec koristimo identifikaciju funkcionalne skupine koja je vezana za sekundarni ugljik atom.
Postoje mnogi prefiksi u organskoj kemiji koje koristimo za prepoznavanje skupina prisutnih u spojevima i za imenovanje organskih molekula kako bismo ih razlikovali. Nadalje, bolji sustav nomenklature može imenovati čak i vrlo složenu molekulu. Primjer: IUPAC nomenklatura je najbolji sustav nomenklature koji daje sve pojedinosti o strukturi kemijskog spoja.
