Ključna razlika između Cis i Trans Face Golgijevog aparata je u tome što je Cisova strana Golgijevog aparata prihvatna strana vezikula od grubog ER do Golgijevog aparata, dok je Trans Face Golgijevog aparata otpremna strana vezikula ispunjenih proteini iz Golgijevog aparata na druga mjesta.
Golgijev aparat jedan je od organela stanice. Stoga se sastoji od vezikula i cisterni. Organela stanice uključuje sortiranje i pakiranje proteina unutarćelijski prije transporta na neko drugo mjesto. Endoplazmatski retikulum tvori vezikule i primopredaje na Golgijev aparat. Cis lice Golgijevog aparata prima vezikule i one se spajaju stvarajući cis cisterne. Cisterne sazrijevaju i kreću se u smjeru cis-a do trans-lica. S pročelja Golgijevog aparata vezikule odlaze iz Golgijevog aparata noseći specifične proteine na druga mjesta.
