Ključna razlika između genetske karte i mape povezanosti je vrsta gena koji se koriste za postupak mapiranja. Genetska karta sastoji se od svih gena prisutnih na određenom kromosomu, dok se karta povezivanja sastoji od povezanih gena prisutnih na određenom kromosomu.
Genetska karta i karta povezivanja dvije su vrste kromosomskih karata koje ilustriraju gene pronađene na kromosomima. Genetska karta prikazuje sve gene, dok karta povezivanja prikazuje samo povezane gene. Obje su vrlo korisne u dijagnostici genetskih bolesti i poremećaja. Osim toga, kromosomske aberacije mogu se također otkriti pomoću genetskih karata i mapa veza. Karte povezivanja dalje pružaju ideju o evoluciji određenih gena.
