Ključna razlika između teorije molekularne orbite i teorije valentne veze je u tome što teorija molekularne orbite opisuje molekularnu formaciju orbite, dok teorija valentne veze opisuje atomske orbitale.
Različite molekule imaju različita kemijska i fizikalna svojstva od pojedinačnih atoma koji su se spojili da bi stvorili te molekule. Da bismo razumjeli ove razlike između atomskih i molekularnih svojstava, potrebno je razumjeti stvaranje kemijske veze između nekoliko atoma da bismo stvorili molekulu. Trenutno koristimo dvije kvantno-mehaničke teorije za opis kovalentne veze i elektroničke strukture molekula. To su teorija valentne veze i teorija molekularnih orbitala.
