Ključna razlika između ionske pare i ionsko-izmjenjivačke kromatografije je u tome što se u ionskoj parnoj kromatografiji ioni u uzorku mogu „upariti“i razdvojiti kao ionski par, dok se u ionsko-izmjenjivačkoj kromatografiji ioni u uzorku mogu odvojiti kao kationi i anioni odvojeno.
Kromatografija je važna tehnika koja dovodi do odvajanja različitih komponenata u smjesi. Kromatografija ionskog para i ionske izmjene analitičke su tehnike koje možemo koristiti za odvajanje iona i polarnih molekula u smjesi, na temelju električnog naboja koji oni nose sa sobom.