Ključna razlika između DNA i RNA nukleotida je u tome što DNA nukleotid ili deoksiribonukleotid sadrži šećer deoksiriboze, dok RNA nukleotid ili ribonukleotid sadrže šećer riboze.
Nukleotidi su osnovna jedinica nukleinskih kiselina. Oni su gradivni blokovi ili monomeri DNA i RNA. Oni se međusobno povezuju da bi stvorili polinukleotidni lanac, koji daje strukturu DNA ili RNA. Tri su glavne komponente u nukleotidu. Oni su dušična baza, pentozni šećer (pet ugljičnih šećera) i fosfatne skupine. Postoji pet različitih dušičnih baza kao što su adenin, timin, citozin, gvanin i uracil. Timin se vidi samo u DNA, dok je uracil jedinstven za RNA. U nukleinskim kiselinama postoje dvije vrste pet ugljičnih šećera. RNA sadrži šećer riboze, dok DNA sadrži šećer deoksiriboze. Nukleotidi sadrže tri fosfatne skupine povezane s pentoznim šećerom.