Ključna razlika između DNA-RNA hibrida i dsDNA je u tome što su DNA-RNA hibridi dvolančani nukleotidi sastavljeni od jednog DNA lanca i jednog komplementarnog RNA lanca, dok je dsDNA dvolančana DNA sastavljena od dva komplementarna DNA lanca.
U svom izvornom stanju DNA je dvolančana. Ima dva komplementarna DNA lanca povezana vodikovim vezama. RNA je jednolančana u svojoj izvornoj strukturi. U nekim slučajevima RNA tvore duplekse s DNA. Poznati su kao DNA-RNA hibridi. Uglavnom nastaju tijekom transkripcije i razmnožavanja onkogenih RNA virusa. U usporedbi s dsDNA, DNA-RNA hibridi su stabilniji.
