Ključna razlika između nukleotida i nukleozida je u tome što nukleotid sadrži fosfatnu skupinu, dok nukleozidu nedostaje fosfatna skupina.
Nukleozidi i nukleotidi slična su vrsta molekula koje se razlikuju blagom strukturnom promjenom. I nukleotid i nukleozid sastoje se od iste dvije komponente; pentozni šećer i dušična baza. Uz to, nukleotid ima jednu ili više fosfatnih skupina. Dakle, dodavanjem fosfatne skupine, nukleozid se enzimima zvanim kinaza može pretvoriti u nukleotid. Nukleotid je gradivni element nukleinskih kiselina. S druge strane, nukleozidi su dobra antikancerogena i antivirusna tvar.