Razlika Između Benzonaze i DNaze

2024 Autor: Mildred Bawerman | [email protected]. Zadnja promjena: 2023-12-16 08:39

Ključna razlika - Benzonase vs DNase

Razgradnja nukleinskih kiselina važna je za mnoge tehnike molekularne biologije. Naširoko se koristi u tehnologiji rekombinantne DNA kako bi se riješio neželjenih fragmenata DNA i RNA. Enzimi koji razgrađuju nukleinsku kiselinu nazivaju se Nukleaze i mogu biti različitih vrsta na temelju potrebne funkcije. Nukleaze koje razgrađuju DNA poznate su kao DNaze, dok su one koje razgrađuju RNA poznate RNaze. Ti se enzimi uglavnom koriste u in vitro pokusima gdje se provode in vitro molekularni testovi kako bi se izolirala čista DNA, RNA ili proteini. Benzonaze su vrsta nukleaza koje razgrađuju i DNA i RNA, dok DNaze razgrađuju samo DNA. To je ključna razlika između benzonaze i DNase.

SADRŽAJ

1. Pregled i ključna razlika

2. Što je benzonaza

3. Što je DNaza

4. Sličnosti između benzonaze i DNaze

5. Usporedna usporedba - Benzonaza vs DNaza u tabličnom obliku

6. Sažetak

Što je benzonaza?

Benzonaza je genetski modificirana endonukleaza iz Serratia marcescens. Ovaj enzim se proizvodi u domaćinima E. coli u industrijskim razmjerima. Benzonaza je sposobna cijepati dvolančanu DNA, linearnu DNA, kružnu DNA i jednolančanu RNA. Stoga je Benzonase komercijalno važan. Enzim benzonaza je protein dimera koji ima 245 identičnih aminokiselina, ~ 30 kDa podjedinica s dvije esencijalne disulfidne veze. Benzonaza cijepa nukleinske kiseline na svom 5 'kraju i rezultira fragmentima sa slobodnih 5' krajeva. Benzonaza može cijepati nukleinske kiseline u bilo kojem slijedu, ali preferira regije bogate GC-om.

Benzonaza se čuva na -20 ⁰ C. Utvrđeno je da je optimalni pH za aktivnost enzima 8,0 - 9,2. Primjene Benzonase uključuju pripremu uzoraka za proteinsku 2D gel elektroforezu gdje Benzonase uklanja vezane nukleinske kiseline i uklanja kontaminante nukleinske kiseline iz rekombinantnih proteinskih pripravaka. Također se koristi za smanjenje viskoznosti proteinskih ekstrakata i sprječavanje nakupljanja stanica u staničnoj smjesi.

Što je DNaza?

DNaza je nukleaza, hidrolitički enzim koji je sposoban samo cijepati dvolančanu DNA. Dvije su glavne vrste DNaza: DNaza I i DNaza II. DNaza I sudjeluje u cijepanju dvolančane DNA da bi proizvela polinukleotide s 5 'slobodnih krajeva. DNaza II uključena je u cijepanje dvolančane DNA kako bi se proizvele polinukleotidne niti s 3 'slobodna kraja ili prevjesima.

DNaza I

DNaza I funkcionira na optimalnom pH između 7,0 - 8,0. Aktivnost enzima ovisi o mnogim ionskim kofaktorima koji uključuju Ca ²⁺, Mg ²⁺ ili Mn ²⁺. Aktivnost Mg ²⁺ i Mn ²⁺ odlučuje o funkciji DNaze I. U prisutnosti Mg ²⁺, DNaza I cijepa svaki lanac dsDNA neovisno. To se događa nasumce. Suprotno tome, u prisutnosti Mn ^2+, enzim cijepa oba lanca DNA na približno istom mjestu. Ovo će cijepanje rezultirati stvaranjem dvije vrste fragmenata DNA; jedan tip s tupim krajevima i drugi tip s jednim ili dva nukleotidna prevjesa.

Slika 02: DNaza

DNaza II

DNaza II funkcionira pri optimalnom pH od 4,5-5,0, a za njezinu aktivnost potrebni su dvovalentni ioni metala, slično DNazi I. Poznato je da se mehanizam DNaze II sastoji od tri glavna koraka.

1. Unutar DNA okosnice inducira se višestruki prekidi s jednim lancem.
2. Proizvode se nukleotidi topivi u kiselini i oligonukleotidi.
3. Nelinearni hiperkromni pomak događa se u posljednjoj fazi.

Glavni inhibitori enzima DNaze uključuju helatore metala, prijelazne metale i kemikalije poput natrijevog dodecil sulfata i β-merkaptoetanola.

Glavne primjene DNaze uključuju pripremu ekstrakata RNA bez ekstrakta i proteinskih ekstrakata te uklanjanje predloška DNA tijekom eksperimenata transkripcije in vitro.

Koje su sličnosti između benzonaze i DNaze?

• Oboje su hidrolitički enzimi.
• Obje su nukleaze.
• Oboje sudjeluju cijepanjem fosfodiesterskih veza nukleinskih kiselina.
• Oboje zahtijevaju optimalan pH i temperature skladištenja da bi se održala aktivnost enzima.
• Inhibitori enzima uključuju helatna sredstva, prijelazne metale i kemikalije za deterdžent.
• Primjene su uglavnom usredotočene na dobivanje ekstrakata DNK, RNA i proteina visoke čistoće.
• Oba enzima mogu se proizvesti genetskim inženjeringom.

Koja je razlika između benzonaze i DNaze?

Diff Article Sredina prije tablice

Benzonaza vs DNase
Benzonaza je enzim koji je sposoban cijepati dvolančanu DNA, linearnu DNA, kružnu DNA i RNA.	DNaza je enzim koji je sposoban cijepati dvolančanu DNA.
Supstrat za enzim
I DNA i RNA supstrat su za benzonazu.	DNA je supstrat za DNazu.
Struktura
Optimalni raspon pH benzonaze je 7,0 -8,0	Optimalni rasponi pH DNaze I su 7,0 - 8,0 i DNaze II 4,5 - 5,0.

Sažetak - Benzonaza vs DNase

Enzimi nukleaze široko se koriste u različitim eksperimentalnim postupcima s obzirom na molekularnu biologiju i genetski inženjering. Benzonaza i DNaza dvije su vrste nukleaza. Benzonaza je uključena u razgradnju i DNA i RNA, dok je DNaza uključena u cijepanje dvolančane DNA. To je osnovna razlika između benzonaze i DNaze. Trenutno se oba ova tipa nukleaza proizvode rekombinantnom DNA tehnologijom koja daje enzime više kvalitete koji su optimizirani za maksimalnu proizvodnju.

Preuzmite PDF verziju Benzonase vs DNase

Možete preuzeti PDF verziju ovog članka i koristiti je u izvanmrežne svrhe prema napomeni. Molimo preuzmite PDF verziju ovdje Razlika između benzonaze i DNase