Ključna razlika između prostaglandina E1 i E2 je u tome što je prostaglandin E1 (PGE1) protuupalni čimbenik, dok je prostaglandin E2 (PGE2) proupalni čimbenik.
Prostaglandini su spojevi dobiveni iz lipida koji imaju hormonalnu funkciju. Oni mogu djelovati kao autokrini ili parakrini spojevi koji dovode do antagonističkih ili sinergijskih učinaka u živim organizmima. Prostaglandin E1 i prostaglandin E2 su dvije vrste, a razlikuju se u funkcionalnosti upale. I prostaglandin E1 i E2 pripadaju istoj obitelji prostaglandina E2, a njihova osnova reakcije i njihovi učinci još nisu u potpunosti razjašnjeni. Koriste se u liječenju različitih biokemijskih mehanizama u živim bićima.