Ključna razlika između Allogamy i Autogamyje je ta što je Allogamyja spoj muških i ženskih spolnih stanica koje dolaze od dviju različitih jedinki, dok je Autogamyja spoj muških i ženskih spolnih stanica iste jedinke. Druga razlika između alogamije i autogameje u odnosu na proizvedeno potomstvo je ta što alogamija daje genetski različito potomstvo, dok autogamija genetički genetički podrazumijeva potomstvo.
Spajanje muške spolne stanice sa ženskom spolnom stanice je oplodnja. Zigota se razvija kao rezultat oplodnje, a zatim se podvrgava staničnoj diobi dajući novo potomstvo. Nadalje, oplodnja može biti dvije vrste; samooplodnja ili unakrsna gnojidba. Alogamija je sinonim za unakrsnu gnojidbu, a Autogamija sinonim za samooplodnju.
