Ključna razlika između estrogena i progesterona je u tome što je estrogen glavni ženski spolni hormon, koji je odgovoran za rast ženskog reproduktivnog sustava i sekundarne spolne karakteristike, dok je progesteron još jedan ženski spolni hormon, koji je važan za održavanje i održavanje trudnoća.
Žene sintetiziraju nekoliko spolnih hormona, uključujući estrogen i progesteron. Oni su steroidni hormoni koji uključuju ženski spol i druge karakteristike ponašanja. Među ova dva hormona, estrogen je glavni ženski spolni hormon, dok je progesteron važan tijekom trudnoće. Oba ova hormona uglavnom stvaraju jajnici, a njihova proizvodnja prirodno opada kada žena dosegne menopauzu. Nadalje, i muškarci i žene proizvode progesteron. Međutim, mužjaci ne mogu stvarati estrogeni hormon.