Ključna razlika između endogenih i egzogenih antigena je u tome što se endogeni antigen generira unutar stanica dok egzogeni antigen ulazi u tijelo izvana.
Antigen je molekula ili tvar koja reagira na produkt specifičnog imunološkog odgovora i potiče stvaranje antitijela. Antigenost te molekule je sposobnost antigena da inducira proizvodnju antitijela. Također, antigeni mogu biti ili protein ili polisaharid. Nadalje, stanice koje prezentiraju antigen (APC), poput dendritičnih stanica, posreduju u procesima usvajanja antigena, obrade antigena i prezentacije antigena. Štoviše, ovisno o imunološkoj aktivnosti, antigeni se mogu klasificirati kao imunogeni, tolerogeni ili alergeni. Osim toga, antigene možemo klasificirati i prema njihovom podrijetlu kao egzogene ili endogene.
