Ključna razlika između izolacije genomske DNA i plazmidne DNA je ta što izolacija genomske DNA cilja na ekstrakciju genomske DNA, dok izolacija plazmidne DNA cilja na ekstrakciju plazmidne DNA bakterija.
Izolacija DNA je kemijski postupak kojim se izolira DNA od različitih vrsta ili iz različitih uzoraka. Izolacija DNA je važna u nizvodnim tehnikama molekularne biologije, poput gel elektroforeze, lančane reakcije polimeraze i tehnika sekvenciranja DNA. Stoga je izolacija DNA važan kemijski proces u molekularno-biološkim studijama. Na temelju svrhe istraživanja, ponekad je potrebno izolirati genomsku DNA. Pored toga, neka se istraživanja usredotočuju na izoliranje plazmidne DNA od bakterija. Izolacija genomske DNA postupak je izolacije genomske DNA iz prokariotskog ili eukariotskog uzorka. Koraci izolacije razlikuju se ovisno o vrsti stanice u kojoj se DNA izolira. Izolacija plazmidne DNA postupak je izoliranja plazmidne DNA iz bakterijske stanice. U usporedbi s izolacijom genomske DNA,cjelokupni proces je složen u izolaciji plazmidne DNA.
