Ključna razlika između klorofila A i B je u tome što je klorofil A primarni fotosintetski pigment u biljkama i algama, dok je klorofil B pomoćni pigment koji sakuplja energiju i prelazi u klorofil A.
Klorofil je obitelj prirodnih pigmenata koji su prisutni u biljkama i algama i odgovoran je za njihovu zelenu boju. Klorofil apsorbira energiju sunčeve svjetlosti i koristi je za sintezu ugljikohidrata iz vode i ugljičnog dioksida. Proces koji se naziva fotosinteza održava životne procese u svim biljkama jer se tim postupkom zadovoljavaju njihove energetske potrebe. Nadalje, fotosinteza je glavni proces koji održava sve žive organizme jer su biljke primarni proizvođači svih prehrambenih lanaca. Životinje i ljudi jedu biljne proizvode. U obitelji klorofilnih pigmenata postoji nekoliko vrsta pigmenata klorofila. Među njima su klorofil A i klorofil B dvije vrste klorofila. Imaju sličnu strukturu s malom razlikom u porfirinskom prstenu. Klorofil A ima CH3 skupine u porfirinskom prstenu dok klorofil B ima CHO (aldehidna skupina) u porfirinskom prstenu.
