Ključna razlika između protoksilema i metaksilema je u tome što je protoksilem prvi formirani primarni ksilem koji ima manje stanice, posebno uske žile i traheide, dok je metaksilem kasnije formirani primarni ksilem koji ima veće stanice, posebno šire žile i traheide.
Ksilem je jedna od dvije vrste vaskularnih tkiva u biljkama. Xylem provodi kretanje vode i minerala prema gore od ostalih korijena do ostalih dijelova biljke. To je struktura nalik cijevi koja sadrži različite vrste specijaliziranih stanica, uključujući elemente žila, traheide, parenhim i vlakna. Postoje dvije vrste ksilema kao primarni i sekundarni ksilem. Primarni ksilem razvija se tijekom primarnog rasta. Nadalje, primarni ksilem ima dva dijela: protoksilem i metaksilem. I protoksilem i metaksilem potječu iz prokambija tijekom primarnog rasta. Protoksilem potječe prvi, a metaksilem potječe nakon protoksilema.