Ključna razlika između pupanja i stvaranja spora je u tome što je pupanje vrsta nespolnog razmnožavanja u kojem novi organizam potječe iz male pupolike strukture razvijene na roditeljskom organizmu, dok je tvorba spora oblik nespolnog razmnožavanja u kojem nove jedinke potječu izravno od spora roditelja.
Pupanje i stvaranje spora dvije su različite metode nespolnog razmnožavanja. I pupanje i stvaranje spora uključuju jednog roditelja. Dakle, nema miješanja ili razmjene genetskog materijala. Zato su potomci nastali pupanjem i stvaranjem spora genetski identični svom roditeljskom organizmu.
