Ključna razlika između binarne fisije i pupanja je u tome što binarna fisija uključuje cijepanje matične stanice na dva dijela mitotskom diobom stanica nakon čega slijedi citokineza bez stvaranja izrasline ili pupa dok pupanje uključuje stvaranje pupa ili izrasline iz matična stanica.
Bespolno razmnožavanje jedna je od dvije vrste razmnožavanja u kojoj potomci potječu od jednog roditelja. Ne uključuje dvoje roditelja ili fuziju dvije vrste spolnih stanica ili mejozu. Stoga su potomci genetski identični roditelju i klonovi su. Bespolno razmnožavanje uobičajeno je među prokarionima i u nekim jednostaničnim i višećelijskim eukarionima. Postoje različite aseksualne metode poput binarne fisije, pupanja, regeneracije, partenogeneze itd.
