Ključna razlika između nasljeđivanja citoplazme i nuklearnog nasljeđa je u tome što se nasljeđivanje citoplazme odvija iz gena prisutnih u citoplazmatskim organelama, dok se nuklearno nasljeđivanje odvija iz gena prisutnih na kromosomima.
Gnojidba je spoj muških i ženskih spolnih stanica. Stoga se tijekom oplodnje haploidna sperma i haploidne jajne stanice ujedinjuju i tvore diploidnu zigotu. Spermijska stanica prenosi svoju jezgru u jajnu stanicu radi fuzije. Rezultirajuća zigota ima citoplazmu jajne stanice. Jednostavnim riječima, citoplazma jajne stanice postaje citoplazma zigote. Štoviše, potomstvo prima gene i iz jezgara i iz gena majčinih citoplazmatskih organela. Geni nukleusa i geni citoplazmatskih organela nasljeđuju potomci. Stoga postoje dvije vrste nasljeđivanja koje se javljaju tijekom spolne oplodnje. Oni su citoplazmatsko nasljeđe i nuklearno nasljeđivanje.