Ključna razlika između zbližavanja umjetnih embrija i prijenosa nuklearnih somatskih stanica je u tome što je umjetno zbližavanje embrija tehnika u kojoj se dijeljenje oplođenog jajašca na dva genetski identična embrija odvija u uvjetima in vitro, dok je prijenos nuklearnih somatskih stanica tehnika u kojoj je umetanje jezgra somatskih stanica u enukleiranu jajnu stanicu odvija se u uvjetima in vitro.
Molekularno kloniranje je važna tehnika u stvaranju rekombinantnih organizama poboljšanih karakteristika. Umjetno zbližavanje embrija i prijenos nuklearnih somatskih stanica dvije su takve tehnike koje se koriste u in vitro uvjetima u svrhu stvaranja klonova u reproduktivne i terapijske svrhe. Međutim, postoji razlika između umjetnog zbližavanja embrija i prijenosa nuklearnih somatskih stanica u smislu njihove metode kloniranja.