Ključna razlika između gljivica i parazita je u tome što su gljive skupina eukariotskih saprotrofnih organizama, uključujući kvasce, plijesni i gljive, dok su paraziti skupina organizama koji žive u ili unutar drugog organizma dobivajući hranjive sastojke.
I gljivice i paraziti uzrokuju razne bolesti kod ljudi. Ne samo kod ljudi, već i paraziti uzrokuju bolesti kod drugih životinja i biljaka. Paraziti su organizmi koji pokazuju način života koji se naziva parazitizam. Parazitizam je jedna od tri vrste simbiotskih odnosa koji postoje između dvije ili više vrsta koje žive zajedno. Određene vrste gljiva, neki insekti, praživotinje i helminti primjeri su parazita. U parazitizmu, paraziti žive u ili unutar drugog organizma koji se naziva domaćinom; parazitizam daje korist samo parazitu, dok domaćinu izaziva bolesti. Štoviše, paraziti ne mogu preživjeti bez svojih domaćina.