Ključna razlika - CRISPR vs RNAi
Uređivanje genoma i modifikacija gena nadolazeća su područja od interesa za genetiku i molekularnu biologiju. Modifikacija gena široko je primjenjiva za studije genske terapije, a koristi se i za utvrđivanje svojstava gena, funkcionalnosti gena i kako bi mutacije gena mogle utjecati na njegovu funkciju. Važno je razviti učinkovite i pouzdane načine za precizne, ciljane promjene u genomu živih stanica. Tehnike poput CRISPR i RNAi koriste se za modificiranje gena s velikom preciznošću. CRISPR ili klasterirani redovno međusobno razmaknuti kratki palindromski ponavljanji prirodni su prokariotski imunološki obrambeni mehanizam koji se nedavno koristi za uređivanje i modificiranje eukariotskih gena. RNAi ili RNA interferencija metoda je specifična za slijed za utišavanje gena uvođenjem male dvolančane RNA koja posreduje s nukleinskim kiselinama i regulira ekspresiju gena. To je ključna razlika između CRISPR-a i RNAi-a.
SADRŽAJ
1. Pregled i ključna razlika
2. Što je CRISPR
3. Što je RNAi
4. Sličnosti između CRISPR-a i RNAi
5. Usporedna usporedba - CRISPR vs RNAi u tabličnom obliku
6. Sažetak
Što je CRISPR?
Sustav CRISPR prirodni je mehanizam prisutan u nekim bakterijama, uključujući E. coli i arheu. Prilagodljiva je imunološka zaštita od invazija na stranim DNA. To je mehanizam specifičan za slijed. Sustav CRISPR sadrži nekoliko elemenata za ponavljanje DNA. Ti su elementi prošarani kratkim "razmaknim" sekvencama izvedenim iz strane DNA i višestrukih Cas gena. Neki od Cas gena su nukleaze. Dakle, kompletni imunološki sustav naziva se CRISPR / Cas sustav.
Slika 01: Sustav CRISPR / Cas
Sustav CRISPR / Cas funkcionira u četiri koraka.
- Sustav genetski veže invaziju segmenata faga i plazmidne DNA (odstojnika) u CRISPR lokus (nazvan korak prikupljanja odstojnika).
- korak sazrijevanja crRNA - Domaćin transkribira i obrađuje CRISPR lokuse kako bi generirao zrelu CRISPR RNA (crRNA) koja sadrži i CRISPR ponovljene elemente i integrirane odstojne elemente.
- Otkrivanje crRNA - To je olakšano komplementarnim uparivanjem baze. To je važno kada je prisutna infekcija i prisutan zarazni agent.
- Korak ciljane interferencije - crRNA otkriva stranu DNK, tvori kompleks sa stranom DNK i štiti domaćina od strane DNK.
Trenutno se sustav CRISPR / Cas koristi za izmjenu ili modifikaciju genoma sisavaca bilo represijom transkripcije ili aktivacijom. Stanice sisavaca mogu odgovoriti na CRISPR / Cas9 posredovane DNA prekide usvajanjem mehanizma popravka. To se može učiniti nehomolognom metodom krajnjeg spajanja (NHEJ) ili popravakom usmjerenim na homologiju (HDR). Oba ova mehanizma popravka odvijaju se uvođenjem dvostrukih prekida. To rezultira uređivanjem gena sisavaca. Stoga se trenutno sustav CRISPR / Cas koristi u područjima terapijske, biomedicinske, poljoprivredne i istraživačke primjene.
Što je RNAi?
RNA interferencija je dvolančana RNA posredovana tehnika koja se koristi za regulaciju ekspresije gena. Glavni uključeni spoj su male interferirajuće RNA (siRNA). SiRNA su posebna vrsta dvolančanih RNA s 3 'nadviskom od dva nukleotida i 5' fosfatnom skupinom. RNA-inducirani kompleks za prigušivanje (RISC) nastaje tijekom interferencije s RNA-om što bi rezultiralo degradacijom gena vezanog za siRNA.
Slika 02: RNAi
Postupak RNAi je sljedeći.
- Dvolančana RNA će se u citoplazmi obraditi endoribonukleazom tipa RNase III nazvanom Dicer za generiranje ~ 21 nukleotidne duge siRNA
- Prijenos siRNA vezanog Dicer-a u Argonaute, uz pomoć dvolančanih proteina koji vežu RNA (dsRNABP).
- Vezivanje Argonauta na jedan pramen dupleksa (vodeći pramen). Ovo će istisnuti drugi pramen. To rezultira čitavim kompleksom protein - RNA koji se naziva RISC.
- Uparivanje RISC kompleksa s jednolančanom RNA vodičem vezanom za Argonaute.
- Uparivanje homologne RNA mete s vodilnom RNA.
- Aktivacija Argonauta rezultira razgradnjom ciljne RNA
U čemu je sličnost između CRISPR-a i RNAi-a?
Obje se koriste kao istraživački alati za modificiranje ekspresije gena
Koja je razlika između CRISPR i RNAi?
Diff Article Sredina prije tablice
CRISPR vs RNAi |
|
| CRISPR je imunološki obrambeni mehanizam koji se nedavno koristi za uređivanje i modificiranje eukariotskih gena. | RNAi je metoda specifična za slijed za utišavanje gena uvođenjem malih dvolančanih |
| Slijed ciljanja | |
| Sintetička RNA (vodeća RNA) ciljni je slijed CRISPR-a. | siRNA je ciljni slijed RNAi. |
| Učinkovitost u suzbijanju gena | |
| Nisko u CRISPR | Visoko u RNAi |
| Učinci | |
| Nokdaun gena događa se u CRISPR-u. | Do nokauta / utišavanja dolazi u RNAi. |
Sažetak - CRISPR vs RNAi
CRISPR ili klasterirani redovno međusobno razmaknuti kratki palindromski ponavljanji prirodni su prokariotski imunološki obrambeni mehanizam koji se nedavno koristi za uređivanje i modificiranje eukariotskih gena. RNAi ili RNA interferencija metoda je specifična za slijed za utišavanje gena uvođenjem male dvolančane RNA koja posreduje s nukleinskim kiselinama i regulira ekspresiju gena. To se može uzeti kao osnovnu razliku između CRISPR-a i RNAi-a. Obje su tehnike, CRISPR / Cas i RNAi, snažni alati za genske manipulacije, iako je CRISPR / Cas zasigurno superiorniji od RNAi, jer se može koristiti za induciranje i insercija i delecija. Specifičnost je također visoka u sustavu CRISPR / Cas.
Preuzmite PDF verziju CRISPR vs RNAi
Možete preuzeti PDF verziju ovog članka i koristiti je u izvanmrežne svrhe prema napomeni. Ovdje preuzmite PDF verziju. Razlika između CRISPR-a i RNAi-a
