Ključna razlika između oligopeptida i polipeptida je u tome što oligopeptidi sadrže malo aminokiselinskih ostataka, dok polipeptidi sadrže velik broj aminokiselinskih ostataka.
Pojmovi oligopeptidi i polipeptidi potpadaju pod kategoriju proteini. Peptidi su kratki lanci aminokiselina. Aminokiseline se međusobno vežu peptidnim vezama. Stoga ove peptide možemo kategorizirati prema broju aminokiselina prisutnih u tim peptidima. Npr. Dipeptidi, tripeptidi, tetrapeptidi, oligopeptidi i polipeptidi.