Ključna razlika između ukupnog broja stanica i broja održivih stanica je u tome što ukupni broj stanica procjenjuje sve stanice uključujući i žive i mrtve mikrobne stanice u uzorku, dok broj održivih stanica procjenjuje samo žive mikrobne stanice u uzorku.
Brojanje broja organizama unutar populacije smatra se neophodnim za većinu eksperimentalnih radova. Stoga pokušavamo analizirati broj mikroba u uzorku izravnim i neizravnim metodama. Izravna mjerenja uključuju metode koje izravno broje stanice. Neizravna mjerenja uključuju mjerenje nekog parametra koji se može povezati s brojem stanica, poput gustoće stanica, suhe težine itd. Neke metode kvantificiraju samo žive mikrobne stanice u uzorku. Brojanje održivih stanica jedna je od takvih metoda. Izravno mikroskopsko brojanje kvantificira sve stanice u poznatom volumenu medija / uzorka pomoću mikroskopa. Stoga broji i žive i mrtve stanice. To je vrsta ukupnog broja stanica.
